广州队足球俱乐部前身是成立于1954年的广州市足球队,1993年1月,广州足球队通过和太阳神集团合作,成为中国第一家政府与企业合股的职业足球俱乐部,开创了中国职业足球的先河,球队分别经历了广州白云山时代(1984-1992年)、广州太阳神时代(1993-2000年)、广州吉利时代(2001年)、广州香雪时代(2002-2003年)、广州日之泉时代(2004-2005年)、广州医药时代(2006年至2009年)和广州恒大时代(2010年至今)7个阶段。
2009年底,中国足坛掀起反赌风暴浪潮,涉嫌打假球的广州广药队被勒令降入2010年中国足球甲级联赛。2010年3月1日,恒大集团以一亿元买断广州足球俱乐部全部股权入,俱乐部正式更名为广州恒大足球俱乐部。2010赛季,球队以联赛第一的成绩提前三轮冲超成功。
2011赛季,广州队创造了44场联赛不败纪录,提前四轮获得中超联赛冠军,为广州足球首次捧起顶级联赛冠军奖杯。
2012赛季,广州队提前一轮成为中国足球历史上第一支中超联赛卫冕冠军,并夺得广州足球历史上的第一座足协杯冠军和超级杯冠军,一年获得三座奖杯。
2013赛季,广州队以77分顶级联赛最高积分和78球顶级联赛最多进球纪录,提前三轮加冕中超冠军,实现中超联赛三连冠。首夺亚冠冠军,创造了中国足球俱乐部夺得首个改制后亚冠联赛冠军的历史,摩洛哥世俱杯夺得第四名。
2014赛季,阿里巴巴集团增资扩股,成为中超联赛第一支四连冠球队,亚冠联赛也连续第三年杀入亚冠八强。
2015赛季,俱乐部新三板挂牌上市成为“亚洲足球第一股”,以26轮中超最长连续不败纪录,成就中超五连冠霸业,创造中超最多夺冠次数新纪录,亚冠赛场再奏凯歌,再次荣登亚洲之巅,日本世俱杯获得第四。
2016赛季初,广州队在超级杯决赛2:0战胜江苏队夺得第二座超级杯奖杯。在该赛季的联赛和足协杯中,广州队均力压江苏苏宁夺得冠军,实现当赛季三冠的壮举并实现中超六连冠。
2017赛季,广州队虽未能在亚冠以及足协杯赛事中登顶,但还是在中超中夺得冠军,也成为中超第一支7冠王队伍。
2018赛季,广州队整个赛季成绩为20胜3平7负积63分,最终屈居亚军。球队自2011年升超以来第一次无缘中超冠军,并且在这一年除了获得年初的超级杯冠军之外,在中超,亚冠及足协杯赛事中无一所获,成为了恒大入主广州队以来成绩最差的一个赛季。
2019赛季,广州恒大淘宝重夺中超联赛冠军。
2021赛季,为了响应中国足协的球队中性名要求,正式改名为广州队。